arXiv cs.AI 发布于 09/25 12:00

BaseCamp --- An Agentic AI Framework for Automating DNA Sequencing Data Pipelines

(翻译)BaseCamp——一个用于自动化DNA测序数据流程的智能体AI框架

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Abstract page for arXiv paper 2609.28557: BaseCamp --- An Agentic AI Framework for Automating DNA Sequencing Data Pipelines

AI 摘要

该论文介绍 BaseCamp,一个用于自动化 DNA 测序数据流程决策层的智能体 AI 框架。它将流程拆分为六个专用智能体,分别覆盖样本接收与质控、比对、变异检测、注释、跨阶段监控和报告;序列分析仍由既有工具执行,智能体负责选择、配置、解释结果并决定后续步骤。框架使用本地微调大模型,在人类监督下运行,避免测序数据离开运行环境,并提升可复现性与异常检测能力。

AI 问答

BaseCamp 的核心目标是什么?

自动化 DNA 测序流程中的决策层,例如选择质控阈值、判定临界变异、诊断异常,以及确定哪些结果需要专家复核。

BaseCamp 的智能体是否直接执行序列分析?

不直接执行。比对、变异检测和注释仍由既有生物信息工具完成,智能体负责选择、配置、解释输出并决定后续步骤。

BaseCamp 如何保护测序数据?

它使用在本地执行的领域专用微调大模型,并由中央推理 LLM 协调,使测序数据不离开运行环境,同时保持人机协同监督。

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