量子位 发布于 09/14 16:17

分子之心QuantaMind登Science Advances,让AI给分子世界”拍电影”

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AI 蛋白质设计迈入“动态时代”

AI 摘要

分子之心自主研发的反应性原子建模平台QuantaMind相关研究发表于《Science Advances》,将接近DFT精度的反应性分子动力学推进至数万原子级体系和数十纳秒尺度,扩展测试达十万原子级与百纳秒级。在约1.8万原子PET水解酶体系中完成完整催化循环模拟,342个构型与DFT的原子力分量相关系数超过0.99,并已用于pH敏感抗体设计与酶工程改造。

AI 问答

QuantaMind 是什么?

它是分子之心自主研发的反应性原子建模平台,相关研究发表于《Science Advances》,可开展接近密度泛函理论(DFT)精度的反应性分子动力学模拟,连续追踪质子转移与化学键断裂/生成过程。

QuantaMind 能达到多大的体系和多长时间尺度?

论文中实际验证的最大体系为24,001原子水体系和17,792原子酶催化体系,最长模拟20纳秒;论文提交后的扩展测试进一步达到十万原子级和百纳秒尺度。

它的计算精度如何验证?

研究团队对17,792原子的PET水解酶体系进行了6纳秒模拟并完成完整催化循环,从轨迹中抽取342个构型做独立DFT单点计算,原子力分量的Pearson相关系数均超过0.99。

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